| 1. Spieltag | 30.07.2016 | FK Rostov | - | FK Orenburg | 1:0 | ||||
| 2. Spieltag | 07.08.2016 | FK Rostov | - | FK Ural | 0:0 |  |
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| 3. Spieltag | 12.08.2016 | Zenit St. Petersburg | - | FK Rostov | 3:2 | ||||
| 4. Spieltag | 20.08.2016 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 28.08.2016 | Terek Grozny | - | FK Rostov | 2:1 | |
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| 6. Spieltag | 09.09.2016 | FK Rostov | - | Krylia Sovetov | 2:1 |  |
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| 14. Spieltag | 18.11.2016 | Rubin Kazan | - | FK Rostov | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 30.11.2016 | FK Ural | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 03.12.2016 | FK Rostov | - | Zenit St. Petersburg | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 03.03.2017 | FK Tom Tomsk | - | FK Rostov | 0:6 | |
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| 19. Spieltag | 12.03.2017 | FK Rostov | - | Terek Grozny | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 19.03.2017 | Krylia Sovetov | - | FK Rostov | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 03.04.2017 | FK Rostov | - | FK Krasnodar | 0:0 | ||||
| 22. Spieltag | 09.04.2017 | Lokomotiv Moskva | - | FK Rostov | 0:0 | |
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| 24. Spieltag | 22.04.2017 | FK Rostov | - | Spartak Moskva | 3:0 | |
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| 26. Spieltag | 30.04.2017 | FK Rostov | - | FK Amkar Perm | 1:0 | |
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| 28. Spieltag | 14.05.2017 | FK Rostov | - | Rubin Kazan | 4:2 | ||||
| 29. Spieltag | 17.05.2017 | Anzhi Makhachkala | - | FK Rostov | 1:2 |
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