| 1. Spieltag | 01.08.2016 | Rubin Kazan | - | FK Amkar Perm | 0:0 |  |
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| 3. Spieltag | 15.08.2016 | FK Orenburg | - | FK Amkar Perm | 0:0 | |
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| 6. Spieltag | 10.09.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Tom Tomsk | 1:0 |  |
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| 7. Spieltag | 17.09.2016 | Terek Grozny | - | FK Amkar Perm | 1:3 | ||||
| 9. Spieltag | 02.10.2016 | FK Ufa | - | FK Amkar Perm | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 15.10.2016 | FK Amkar Perm | - | Lokomotiv Moskva | 0:0 | ||||
| 11. Spieltag | 23.10.2016 | FK Krasnodar | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 12. Spieltag | 29.10.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 13. Spieltag | 06.11.2016 | CSKA Moskva | - | FK Amkar Perm | 2:2 | ||||
| 15. Spieltag | 26.11.2016 | FK Amkar Perm | - | Arsenal Tula | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 01.12.2016 | Anzhi Makhachkala | - | FK Amkar Perm | 3:1 | ||||
| 19. Spieltag | 12.03.2017 | FK Amkar Perm | - | Zenit St. Petersburg | 1:0 | ||||
| 20. Spieltag | 18.03.2017 | FK Tom Tomsk | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 08.04.2017 | Krylia Sovetov | - | FK Amkar Perm | 2:2 | ||||
| 27. Spieltag | 06.05.2017 | FK Amkar Perm | - | CSKA Moskva | 0:2 | |
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| 28. Spieltag | 13.05.2017 | FK Amkar Perm | - | Spartak Moskva | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 21.05.2017 | FK Amkar Perm | - | Rubin Kazan | 1:2 |
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