| 1. Runde | 18.09.2008 | AC Bellinzona | - | Galatasaray | 3:4 | ||||
| 1. Runde | 02.10.2008 | Galatasaray | - | AC Bellinzona | 2:1 | ||||
| Gruppe B | 23.10.2008 | Galatasaray | - | Olympiakos Piraeus | 1:0 |  |
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| Gruppe B | 06.11.2008 | SL Benfica | - | Galatasaray | 0:2 |  |
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| Gruppe B | 27.11.2008 | Galatasaray | - | Metalist Kharkiv | 0:1 | ||||
| 3. Runde | 18.02.2009 | Girondins Bordeaux | - | Galatasaray | 0:0 | |
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| 3. Runde | 26.02.2009 | Galatasaray | - | Girondins Bordeaux | 4:3 | ||||
| Achtelfinale | 12.03.2009 | Hamburger SV | - | Galatasaray | 1:1 |  |
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