| 1. Spieltag | 18.01.2004 | Atlas Guadalajara | - | Puebla FC | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 25.01.2004 | Puebla FC | - | Real San Luis | 1:2 | ||||
| 3. Spieltag | 01.02.2004 | Santos Laguna | - | Puebla FC | 2:0 |  |
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| 4. Spieltag | 08.02.2004 | Puebla FC | - | Atlante | 1:1 |  |
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| 5. Spieltag | 14.02.2004 | Jaguares Chiapas | - | Puebla FC | 3:1 |  |
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| 7. Spieltag | 26.02.2004 | Monarcas Morelia | - | Puebla FC | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 29.02.2004 | Puebla FC | - | Gallos Blancos (old) | 1:0 | ||||
| 9. Spieltag | 07.03.2004 | UANL Tigres | - | Puebla FC | 2:3 | ||||
| 10. Spieltag | 14.03.2004 | Puebla FC | - | Deportivo Toluca | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 21.03.2004 | Deportivo Guadalajara | - | Puebla FC | 0:0 | ||||
| 12. Spieltag | 28.03.2004 | Puebla FC | - | Club Necaxa | 2:2 | ||||
| 15. Spieltag | 18.04.2004 | Puebla FC | - | Cruz Azul | 3:2 | ||||
| 17. Spieltag | 02.05.2004 | Puebla FC | - | UAG Tecos | 0:1 | ||||
| 18. Spieltag | 09.05.2004 | CF Monterrey | - | Puebla FC | 2:2 | |
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| 19. Spieltag | 16.05.2004 | Puebla FC | - | CF América | 1:3 |
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