| 6. Spieltag | 10.09.2016 | FK Orenburg | - | Anzhi Makhachkala | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 16.09.2016 | FK Orenburg | - | Spartak Moskva | 1:3 | ||||
| 9. Spieltag | 01.10.2016 | Terek Grozny | - | FK Orenburg | 2:1 | ||||
| 10. Spieltag | 16.10.2016 | FK Orenburg | - | FK Tom Tomsk | 3:1 | ||||
| 11. Spieltag | 24.10.2016 | Zenit St. Petersburg | - | FK Orenburg | 1:0 |  |
|||
| 12. Spieltag | 31.10.2016 | FK Orenburg | - | Krylia Sovetov | 1:0 | ||||
| 13. Spieltag | 06.11.2016 | FK Krasnodar | - | FK Orenburg | 3:3 | ||||
| 14. Spieltag | 19.11.2016 | FK Orenburg | - | Lokomotiv Moskva | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 25.11.2016 | FK Ufa | - | FK Orenburg | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 30.11.2016 | CSKA Moskva | - | FK Orenburg | 2:0 | ||||
| 17. Spieltag | 05.12.2016 | FK Amkar Perm | - | FK Orenburg | 3:0 | |
|||
| 18. Spieltag | 04.03.2017 | FK Orenburg | - | Arsenal Tula | 3:0 | ||||
| 19. Spieltag | 11.03.2017 | Rubin Kazan | - | FK Orenburg | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 17.03.2017 | Anzhi Makhachkala | - | FK Orenburg | 1:0 | ||||
| 28. Spieltag | 13.05.2017 | Lokomotiv Moskva | - | FK Orenburg | 4:0 | ||||
| 29. Spieltag | 17.05.2017 | FK Orenburg | - | FK Ufa | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 21.05.2017 | FK Orenburg | - | FK Rostov | 2:0 | |
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