| 1. Spieltag | 16.08.2008 | SV Babelsberg 03 | - | VfB Lübeck | 1:0 | ||||
| 3. Spieltag | 31.08.2008 | SV Babelsberg 03 | - | 1. FC Magdeburg | 2:0 | ||||
| 2. Spieltag | 03.09.2008 | SV Wilhelmshaven | - | SV Babelsberg 03 | 1:1 |  |
|||
| 8. Spieltag | 18.10.2008 | Chemnitzer FC | - | SV Babelsberg 03 | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 28.02.2009 | 1. FC Magdeburg | - | SV Babelsberg 03 | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 14.03.2009 | Altona 93 | - | SV Babelsberg 03 | 1:2 | |
|||
| 23. Spieltag | 21.03.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Türkiyemspor Berlin | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 28.03.2009 | FC Oberneuland | - | SV Babelsberg 03 | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 11.04.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Chemnitzer FC | 3:1 | ||||
| 26. Spieltag | 18.04.2009 | Hannover 96 II | - | SV Babelsberg 03 | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 25.04.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Holstein Kiel | 0:2 | ||||
| 28. Spieltag | 01.05.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Hansa Rostock II | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 13.05.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Hamburger SV II | 6:1 | ||||
| 31. Spieltag | 17.05.2009 | Hertha BSC II | - | SV Babelsberg 03 | 2:2 | ||||
| 34. Spieltag | 06.06.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Sachsen Leipzig | 1:0 |
Deutschland