| 1. Spieltag | 26.07.2008 | Yverdon Sport FC | - | FC Stade Nyonnais | 3:0 | ||||
| 2. Spieltag | 02.08.2008 | FC Stade Nyonnais | - | FC Biel/Bienne | 2:4 | ||||
| 3. Spieltag | 09.08.2008 | FC Locarno | - | FC Stade Nyonnais | 3:0 | ||||
| 4. Spieltag | 16.08.2008 | FC Stade Nyonnais | - | Servette FC | 1:0 | ||||
| 5. Spieltag | 22.08.2008 | FC La Chaux-de-Fonds | - | FC Stade Nyonnais | 0:2 |  |
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| 6. Spieltag | 30.08.2008 | FC Stade Nyonnais | - | FC Gossau | 1:3 | ||||
| 10. Spieltag | 25.10.2008 | FC Stade Nyonnais | - | FC Thun | 0:2 | ||||
| 11. Spieltag | 01.11.2008 | FC Lausanne-Sport | - | FC Stade Nyonnais | 1:0 | ||||
| 12. Spieltag | 08.11.2008 | FC Stade Nyonnais | - | FC Lugano | 0:2 | |
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| 13. Spieltag | 16.11.2008 | FC Winterthur | - | FC Stade Nyonnais | 1:2 | |
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| 24. Spieltag | 22.04.2009 | FC Thun | - | FC Stade Nyonnais | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 02.05.2009 | FC Lugano | - | FC Stade Nyonnais | 4:0 | ||||
| 28. Spieltag | 17.05.2009 | FC Stade Nyonnais | - | Yverdon Sport FC | 1:3 | |
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