| 3. Spieltag | 18.03.2006 | FC Tokyo | - | Shimizu S-Pulse | 0:1 | ||||
| 4. Spieltag | 21.03.2006 | Shimizu S-Pulse | - | JEF United Chiba | 1:2 | ||||
| 8. Spieltag | 15.04.2006 | Kashima Antlers | - | Shimizu S-Pulse | 3:1 | ||||
| 9. Spieltag | 22.04.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Urawa Red Diamonds | 2:1 | ||||
| 10. Spieltag | 29.04.2006 | Kawasaki Frontale | - | Shimizu S-Pulse | 2:2 | ||||
| 13. Spieltag | 19.07.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 23.07.2006 | Kyoto Purple Sanga | - | Shimizu S-Pulse | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 12.08.2006 | Sanfrecce Hiroshima | - | Shimizu S-Pulse | 1:2 | ||||
| 21. Spieltag | 30.08.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Kyoto Purple Sanga | 1:0 |  |
|||
| 22. Spieltag | 09.09.2006 | JEF United Chiba | - | Shimizu S-Pulse | 1:3 | ||||
| 24. Spieltag | 23.09.2006 | Urawa Red Diamonds | - | Shimizu S-Pulse | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 01.10.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Avispa Fukuoka | 4:0 | ||||
| 26. Spieltag | 07.10.2006 | Cerezo Osaka | - | Shimizu S-Pulse | 1:1 | ||||
| 27. Spieltag | 14.10.2006 | Nagoya Grampus Eight | - | Shimizu S-Pulse | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 21.10.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Albirex Niigata | 1:1 |
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