| 16. Spieltag | 15.03.2025 | FC Uster | - | FC Schaffhausen II | 3:4 | ||||
| 17. Spieltag | 22.03.2025 | FC Schaffhausen II | - | FC Wil 1900 II | 1:0 |  |
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| 18. Spieltag | 29.03.2025 | KF Dardania St. Gallen | - | FC Schaffhausen II | 2:1 | |
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| 20. Spieltag | 13.04.2025 | FC Altstätten | - | FC Schaffhausen II | 1:3 | ||||
| 21. Spieltag | 16.04.2025 | FC Schaffhausen II | - | FC Bazenheid | 5:0 | ||||
| 23. Spieltag | 30.04.2025 | FC Schaffhausen II | - | FC Bülach | 1:3 | ||||
| 24. Spieltag | 03.05.2025 | FC Arbon 05 | - | FC Schaffhausen II | 2:7 | ||||
| 26. Spieltag | 17.05.2025 | FC Schaffhausen II | - | FC Gossau | 1:2 | ||||
| 27. Spieltag | 24.05.2025 | FC Red Star Zürich | - | FC Schaffhausen II | 1:4 |  |
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| 28. Spieltag | 31.05.2025 | FC Schaffhausen II | - | FC Frauenfeld | 3:1 | ||||
| 29. Spieltag | 11.06.2025 | FC Balzers | - | FC Schaffhausen II | -:- |
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