| 6. Spieltag | 22.08.2008 | 1. FC RFE Vöcklabruck | - | SKNV St. Pölten | 0:3 | ||||
| 15. Spieltag | 07.11.2008 | SKNV St. Pölten | - | DSV Leoben | 3:0 | ||||
| 16. Spieltag | 11.11.2008 | FC Lustenau | - | SKNV St. Pölten | 2:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.11.2008 | SKNV St. Pölten | - | 1. FC RFE Vöcklabruck | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 29.11.2008 | SKNV St. Pölten | - | Austria Wien (A) | 2:1 | ||||
| 20. Spieltag | 06.03.2009 | FC Gratkorn | - | SKNV St. Pölten | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 20.03.2009 | FC Wacker Innsbruck | - | SKNV St. Pölten | 3:0 | ||||
| 24. Spieltag | 03.04.2009 | SKNV St. Pölten | - | FC Gratkorn | 0:0 | ||||
| 25. Spieltag | 10.04.2009 | Austria Wien (A) | - | SKNV St. Pölten | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 18.04.2009 | SKNV St. Pölten | - | RB Salzburg (A) | 3:1 | ||||
| 28. Spieltag | 01.05.2009 | SKNV St. Pölten | - | 1. FC RFE Vöcklabruck | 5:1 | ||||
| 29. Spieltag | 08.05.2009 | SV Grödig | - | SKNV St. Pölten | 2:0 |  |
|||
| 33. Spieltag | 29.05.2009 | SKNV St. Pölten | - | Austria Lustenau | 1:1 | |
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