| 1. Spieltag | 03.08.2003 | Erzgebirge Aue | - | Jahn Regensburg | 0:1 | ||||
| 2. Spieltag | 08.08.2003 | Jahn Regensburg | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:0 | ||||
| 4. Spieltag | 22.08.2003 | Jahn Regensburg | - | VfB Lübeck | 0:4 | ||||
| 6. Spieltag | 19.09.2003 | Jahn Regensburg | - | Arminia Bielefeld | 1:2 | ||||
| 7. Spieltag | 28.09.2003 | Jahn Regensburg | - | Eintracht Trier | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 05.10.2003 | 1. FC Union Berlin | - | Jahn Regensburg | 2:2 |  |
|||
| 10. Spieltag | 24.10.2003 | 1. FC Nürnberg | - | Jahn Regensburg | 3:2 | ||||
| 15. Spieltag | 05.12.2003 | Jahn Regensburg | - | Wacker Burghausen | 0:2 |
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