| 20. Spieltag | 12.02.2017 | SC Freiburg | - | 1. FC Köln | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 19.02.2017 | 1. FC Köln | - | FC Schalke 04 | 1:1 |  |
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| 22. Spieltag | 25.02.2017 | RB Leipzig | - | 1. FC Köln | 3:1 | ||||
| 23. Spieltag | 04.03.2017 | 1. FC Köln | - | Bayern München | 0:3 | ||||
| 24. Spieltag | 11.03.2017 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Köln | 2:2 | ||||
| 25. Spieltag | 18.03.2017 | 1. FC Köln | - | Hertha BSC | 4:2 | ||||
| 26. Spieltag | 01.04.2017 | Hamburger SV | - | 1. FC Köln | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 04.04.2017 | 1. FC Köln | - | Eintracht Frankfurt | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 21.04.2017 | 1. FC Köln | - | 1899 Hoffenheim | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 29.04.2017 | Borussia Dortmund | - | 1. FC Köln | 0:0 | ||||
| 32. Spieltag | 05.05.2017 | 1. FC Köln | - | Werder Bremen | 4:3 | ||||
| 33. Spieltag | 13.05.2017 | Bayer Leverkusen | - | 1. FC Köln | 2:2 |
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