| 1. Spieltag | 24.07.2016 | FC Le Mont | - | FC Wohlen | 0:3 |  |
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| 2. Spieltag | 29.07.2016 | FC Wohlen | - | Neuchâtel Xamax FCS | 0:0 | ||||
| 3. Spieltag | 06.08.2016 | FC Zürich | - | FC Wohlen | 4:0 | ||||
| 4. Spieltag | 10.08.2016 | FC Wohlen | - | FC Chiasso | 1:2 | ||||
| 5. Spieltag | 21.08.2016 | FC Winterthur | - | FC Wohlen | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 27.08.2016 | FC Wohlen | - | FC Wil 1900 | 1:3 | ||||
| 7. Spieltag | 11.09.2016 | Servette FC | - | FC Wohlen | 6:1 | ||||
| 8. Spieltag | 21.09.2016 | FC Wohlen | - | FC Aarau | 1:4 | ||||
| 10. Spieltag | 02.10.2016 | FC Wohlen | - | FC Zürich | 0:5 | ||||
| 11. Spieltag | 17.10.2016 | Neuchâtel Xamax FCS | - | FC Wohlen | 1:4 | ||||
| 12. Spieltag | 22.10.2016 | FC Wohlen | - | FC Le Mont | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 06.11.2016 | FC Wohlen | - | Servette FC | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 26.11.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Wohlen | 1:2 | ||||
| 17. Spieltag | 04.12.2016 | FC Aarau | - | FC Wohlen | 1:0 | |
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| 21. Spieltag | 20.02.2017 | FC Winterthur | - | FC Wohlen | 2:1 |
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