| 1. Spieltag | 03.08.2024 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Basel 1893 II | 5:2 | ||||
| 3. Spieltag | 28.08.2024 | FC Rapperswil-Jona | - | SR Delémont | 3:0 | ||||
| 6. Spieltag | 07.09.2024 | BSC Young Boys II | - | FC Rapperswil-Jona | 1:3 | ||||
| 11. Spieltag | 12.10.2024 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Biel/Bienne | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 26.10.2024 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Luzern II | 3:3 |  |
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| 15. Spieltag | 02.11.2024 | FC Grand-Saconnex | - | FC Rapperswil-Jona | 3:0 | ||||
| 16. Spieltag | 09.11.2024 | FC Rapperswil-Jona | - | SC Cham | 1:2 | ||||
| 17. Spieltag | 16.11.2024 | FC Bavois | - | FC Rapperswil-Jona | 0:1 |  |
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| 18. Spieltag | 09.02.2025 | FC Basel 1893 II | - | FC Rapperswil-Jona | 0:3 | ||||
| 19. Spieltag | 15.02.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Paradiso | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 01.03.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | Vevey-Sports | 3:0 | ||||
| 22. Spieltag | 08.03.2025 | FC Bulle | - | FC Rapperswil-Jona | 1:2 | |
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| 26. Spieltag | 05.04.2025 | FC Breitenrain Bern | - | FC Rapperswil-Jona | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 26.04.2025 | SC Kriens | - | FC Rapperswil-Jona | 1:5 | ||||
| 32. Spieltag | 10.05.2025 | FC Rapperswil-Jona | - | FC Grand-Saconnex | 4:2 |
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