| 18. Spieltag | 01.02.2004 | Jahn Regensburg | - | Erzgebirge Aue | 1:1 | ||||
| 19. Spieltag | 08.02.2004 | SpVgg Greuther Fürth | - | Jahn Regensburg | 2:2 | ||||
| 20. Spieltag | 15.02.2004 | Jahn Regensburg | - | MSV Duisburg | 0:5 |  |
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| 23. Spieltag | 07.03.2004 | Arminia Bielefeld | - | Jahn Regensburg | 0:0 | ||||
| 24. Spieltag | 12.03.2004 | Eintracht Trier | - | Jahn Regensburg | 4:0 | ||||
| 25. Spieltag | 21.03.2004 | Jahn Regensburg | - | 1. FC Union Berlin | 3:1 | ||||
| 29. Spieltag | 16.04.2004 | Jahn Regensburg | - | Rot-Weiß Oberhausen | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 25.04.2004 | LR Ahlen | - | Jahn Regensburg | 3:1 |  |
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| 34. Spieltag | 23.05.2004 | Energie Cottbus | - | Jahn Regensburg | 3:0 |
Tschechien