| 1. Spieltag | 20.07.2024 | MFK Vyškov | - | 1. SK Prostějov | 0:0 |  |
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| 2. Spieltag | 27.07.2024 | Sigma Olomouc B | - | 1. SK Prostějov | 0:0 | |
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| 3. Spieltag | 31.07.2024 | 1. SK Prostějov | - | FC Zlín | 0:2 | ||||
| 4. Spieltag | 04.08.2024 | Viktoria Žižkov | - | 1. SK Prostějov | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 09.08.2024 | 1. SK Prostějov | - | FC Sellier & Bellot Vlašim | 1:1 | ||||
| 8. Spieltag | 01.09.2024 | Slavia Praha B | - | 1. SK Prostějov | 2:2 | ||||
| 11. Spieltag | 28.09.2024 | 1. SK Prostějov | - | FK Varnsdorf | 1:1 | ||||
| 9. Spieltag | 02.10.2024 | 1. SK Prostějov | - | Zbrojovka Brno | 3:1 | ||||
| 12. Spieltag | 06.10.2024 | AC Sparta Praha B | - | 1. SK Prostějov | 5:2 | ||||
| 13. Spieltag | 21.10.2024 | 1. SK Prostějov | - | MFK Chrudim | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 26.10.2024 | SK Líšeň | - | 1. SK Prostějov | 2:0 | ||||
| 15. Spieltag | 01.11.2024 | 1. SK Prostějov | - | FK MAS Táborsko | 3:3 |
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