| 1. Runde | 16.09.1999 | Vojvodina | - | Slavia Praha | 0:0 | ||||
| 1. Runde | 30.09.1999 | Slavia Praha | - | Vojvodina | 3:2 | ||||
| 2. Runde | 21.10.1999 | Slavia Praha | - | Grasshopper Club Zürich | 3:1 | ||||
| 2. Runde | 04.11.1999 | Grasshopper Club Zürich | - | Slavia Praha | 1:0 | ||||
| 3. Runde | 25.11.1999 | Slavia Praha | - | AFC Steaua București | 4:1 |  |
|||
| 3. Runde | 09.12.1999 | AFC Steaua București | - | Slavia Praha | 1:1 | ||||
| Achtelfinale | 29.02.2000 | Slavia Praha | - | Udinese Calcio | 1:0 | ||||
| Achtelfinale | 07.03.2000 | Udinese Calcio | - | Slavia Praha | 2:1 | ||||
| Viertelfinale | 16.03.2000 | Leeds United | - | Slavia Praha | 3:0 |
Tschechien