| 17. Spieltag | 17.02.2024 | FC Winterthur [B-Junioren] | - | FCO St. Gallen [B-Junioren] | 3:0 |  |
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| 18. Spieltag | 24.02.2024 | Servette FC [B-Junioren] | - | FC Winterthur [B-Junioren] | 4:3 | ||||
| 15. Spieltag | 02.03.2024 | FC Winterthur [B-Junioren] | - | FC Luzern [B-Junioren] | 1:3 | ||||
| 19. Spieltag | 09.03.2024 | FC Zürich [B-Junioren] | - | FC Winterthur [B-Junioren] | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 16.03.2024 | FC Winterthur [B-Junioren] | - | FC Thun Berner Oberland [B-Junioren] | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 23.03.2024 | FC Lausanne-Sport [B-Junioren] | - | FC Winterthur [B-Junioren] | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 06.04.2024 | FC Winterthur [B-Junioren] | - | BSC Young Boys [B-Junioren] | 3:1 | ||||
| 23. Spieltag | 13.04.2024 | FC Sion [B-Junioren] | - | FC Winterthur [B-Junioren] | 3:0 |  |
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| 24. Spieltag | 20.04.2024 | FC Winterthur [B-Junioren] | - | FC Aarau [B-Junioren] | 8:0 | ||||
| 25. Spieltag | 27.04.2024 | FC Winterthur [B-Junioren] | - | FC Basel 1893 [B-Junioren] | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 04.05.2024 | Grasshopper Club Zürich [B-Junioren] | - | FC Winterthur [B-Junioren] | 0:4 |
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