| 22. Spieltag | 15.12.2012 | Karlsruher SC | - | VfB Stuttgart II | 3:1 | ||||
| 25. Spieltag | 12.03.2013 | VfB Stuttgart II | - | SpVgg Unterhaching | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 16.03.2013 | Hansa Rostock | - | VfB Stuttgart II | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 31.03.2013 | VfB Stuttgart II | - | SV Wehen Wiesbaden | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 03.04.2013 | VfB Stuttgart II | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 06.04.2013 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | VfB Stuttgart II | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 10.04.2013 | SV Babelsberg 03 | - | VfB Stuttgart II | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 13.04.2013 | VfB Stuttgart II | - | Hallescher FC | 3:0 | ||||
| 34. Spieltag | 20.04.2013 | VfB Stuttgart II | - | Wacker Burghausen | 0:0 | ||||
| 35. Spieltag | 27.04.2013 | VfL Osnabrück | - | VfB Stuttgart II | 2:0 | ||||
| 36. Spieltag | 03.05.2013 | VfB Stuttgart II | - | Arminia Bielefeld | 0:1 | ||||
| 37. Spieltag | 11.05.2013 | Alemannia Aachen | - | VfB Stuttgart II | 4:2 | ||||
| 38. Spieltag | 18.05.2013 | VfB Stuttgart II | - | Borussia Dortmund II | 0:1 |  |
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