| 10. Spieltag | 26.09.2013 | FK Tom Tomsk | - | Volga Nizhniy Novgorod | 1:0 |  |
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| 11. Spieltag | 30.09.2013 | Lokomotiv Moskva | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | |
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| 12. Spieltag | 06.10.2013 | FK Tom Tomsk | - | Zenit St. Petersburg | 0:3 | ||||
| 13. Spieltag | 19.10.2013 | FK Krasnodar | - | FK Tom Tomsk | 4:0 | |
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| 14. Spieltag | 26.10.2013 | FK Tom Tomsk | - | Terek Grozny | 0:0 | ||||
| 15. Spieltag | 02.11.2013 | Dinamo Moskva | - | FK Tom Tomsk | 1:0 | |
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| 19. Spieltag | 08.12.2013 | Terek Grozny | - | FK Tom Tomsk | 2:0 |  |
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