| 1. Spieltag | 03.03.2007 | Urawa Red Diamonds | - | Yokohama FC | 2:1 | ||||
| 2. Spieltag | 10.03.2007 | Yokohama FC | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 |  |
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| 3. Spieltag | 17.03.2007 | Kawasaki Frontale | - | Yokohama FC | 6:0 | ||||
| 4. Spieltag | 01.04.2007 | Yokohama FC | - | Nagoya Grampus Eight | 1:2 | ||||
| 7. Spieltag | 21.04.2007 | FC Tokyo | - | Yokohama FC | 1:0 |  |
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| 9. Spieltag | 03.05.2007 | Ventforet Kofu | - | Yokohama FC | 1:0 | ||||
| 11. Spieltag | 12.05.2007 | Sanfrecce Hiroshima | - | Yokohama FC | 0:2 | |
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| 12. Spieltag | 19.05.2007 | RB Omiya Ardija | - | Yokohama FC | 1:0 | ||||
| 13. Spieltag | 26.05.2007 | Yokohama FC | - | Oita Trinita | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 09.06.2007 | Gamba Osaka | - | Yokohama FC | 2:1 | ||||
| 15. Spieltag | 16.06.2007 | Yokohama FC | - | Júbilo Iwata | 1:2 | |
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| 18. Spieltag | 30.06.2007 | Yokohama FC | - | JEF United Chiba | 0:1 |
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