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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FK Zalgiris | 9 | 6 | 3 | 0 | 17:2 | 15 | 21 |
| 2 |
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Zalgiris Kaunas | 9 | 5 | 4 | 0 | 18:5 | 13 | 19 |
| 3 |
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FK Atlantas | 9 | 5 | 4 | 0 | 15:9 | 6 | 19 |
| 4 |
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Inkaras Kaunas | 9 | 5 | 1 | 3 | 16:8 | 8 | 16 |
| 5 |
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FK Ekranas | 9 | 3 | 5 | 1 | 11:3 | 8 | 14 |
| 6 |
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FK Kareda Siauliai | 9 | 4 | 2 | 3 | 15:8 | 7 | 14 |
| 7 |
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Ardena Vilnius | 9 | 1 | 4 | 4 | 5:13 | -8 | 7 |
| 8 |
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FK Banga Gargždai | 9 | 1 | 2 | 6 | 4:23 | -19 | 5 |
| 9 |
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FK Nevėžis | 9 | 0 | 4 | 5 | 4:13 | -9 | 4 |
| 10 |
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FK Dainava Alytus | 9 | 0 | 1 | 8 | 4:25 | -21 | 1 |
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# Banga - Ardena (03.10.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Banga gewertet, wobei Banga die drei Punkte zugesprochen bekam. |
