| 15. Spieltag | 01.11.2008 | Milton Keynes Dons | - | Tranmere Rovers | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 15.11.2008 | Tranmere Rovers | - | Southend United | 2:2 | ||||
| 17. Spieltag | 22.11.2008 | Yeovil Town | - | Tranmere Rovers | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 28.12.2008 | Tranmere Rovers | - | Walsall FC | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 14.02.2009 | Southend United | - | Tranmere Rovers | 2:1 | ||||
| 25. Spieltag | 17.02.2009 | Tranmere Rovers | - | Peterborough United | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 21.02.2009 | Tranmere Rovers | - | Milton Keynes Dons | 1:1 | ||||
| 38. Spieltag | 14.03.2009 | Tranmere Rovers | - | Huddersfield Town | 3:1 | ||||
| 39. Spieltag | 21.03.2009 | Oldham Athletic | - | Tranmere Rovers | 0:2 | ||||
| 40. Spieltag | 28.03.2009 | Brighton & Hove Albion | - | Tranmere Rovers | 0:0 | ||||
| 41. Spieltag | 05.04.2009 | Tranmere Rovers | - | Bristol Rovers | 2:0 |  |
|||
| 42. Spieltag | 11.04.2009 | Walsall FC | - | Tranmere Rovers | 0:1 | ||||
| 46. Spieltag | 02.05.2009 | Scunthorpe United | - | Tranmere Rovers | 1:1 |
England