| 14. Spieltag | 23.10.2012 | Crawley Town | - | Milton Keynes Dons | 2:0 | ||||
| 15. Spieltag | 27.10.2012 | Scunthorpe United | - | Milton Keynes Dons | 0:3 | ||||
| 16. Spieltag | 07.11.2012 | Milton Keynes Dons | - | Leyton Orient | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 10.11.2012 | Milton Keynes Dons | - | Sheffield United | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 16.11.2012 | Tranmere Rovers | - | Milton Keynes Dons | 0:1 | ||||
| 19. Spieltag | 20.11.2012 | Shrewsbury Town | - | Milton Keynes Dons | 2:2 |  |
|||
| 20. Spieltag | 24.11.2012 | Milton Keynes Dons | - | Colchester United | 5:1 | ||||
| 21. Spieltag | 08.12.2012 | Brentford FC | - | Milton Keynes Dons | 3:2 | ||||
| 22. Spieltag | 15.12.2012 | Milton Keynes Dons | - | Hartlepool United | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 26.12.2012 | Milton Keynes Dons | - | Walsall FC | 2:4 | ||||
| 25. Spieltag | 29.12.2012 | Milton Keynes Dons | - | Coventry City | 2:3 | ||||
| 26. Spieltag | 01.01.2013 | Notts County | - | Milton Keynes Dons | 1:2 |
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