| 1. Spieltag | 29.07.2016 | Wuppertaler SV | - | Viktoria Köln | 3:3 | ||||
| 2. Spieltag | 06.08.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Wuppertaler SV | 2:2 | ||||
| 3. Spieltag | 09.08.2016 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiss Essen | 0:0 | ||||
| 4. Spieltag | 13.08.2016 | SV Rödinghausen | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 5. Spieltag | 20.08.2016 | Wuppertaler SV | - | Rot Weiss Ahlen | 4:0 |  |
|||
| 6. Spieltag | 27.08.2016 | SC Verl | - | Wuppertaler SV | 2:2 | ||||
| 7. Spieltag | 05.09.2016 | Wuppertaler SV | - | Alemannia Aachen | 2:2 | ||||
| 8. Spieltag | 10.09.2016 | Borussia Dortmund II | - | Wuppertaler SV | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 17.09.2016 | Wuppertaler SV | - | FC Schalke 04 II | 0:2 | ||||
| 10. Spieltag | 24.09.2016 | 1. FC Köln II | - | Wuppertaler SV | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 15.10.2016 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Oberhausen | 2:1 | ||||
| 15. Spieltag | 29.10.2016 | Wuppertaler SV | - | SC Wiedenbrück | 1:1 |  |
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| 17. Spieltag | 12.11.2016 | Wuppertaler SV | - | Bor. Mönchengladbach II | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 04.03.2017 | Wuppertaler SV | - | SC Verl | 0:0 | ||||
| 26. Spieltag | 25.03.2017 | FC Schalke 04 II | - | Wuppertaler SV | 4:2 | ||||
| 33. Spieltag | 13.05.2017 | Wuppertaler SV | - | Bonner SC | 0:0 |
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