| 9. Spieltag | 16.09.2006 | Swindon Town | - | Peterborough United | 0:1 | ||||
| 10. Spieltag | 23.09.2006 | Peterborough United | - | Hartlepool United | 3:5 | ||||
| 11. Spieltag | 26.09.2006 | Peterborough United | - | Barnet FC | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 30.09.2006 | Stockport County | - | Peterborough United | 0:1 |  |
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| 13. Spieltag | 06.10.2006 | Milton Keynes Dons | - | Peterborough United | 0:2 | ||||
| 14. Spieltag | 14.10.2006 | Peterborough United | - | Shrewsbury Town | 2:1 | ||||
| 15. Spieltag | 21.10.2006 | Wycombe Wanderers | - | Peterborough United | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 09.12.2006 | Rochdale AFC | - | Peterborough United | 0:1 |
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