| 1. Spieltag | 29.07.2017 | Weiche Flensburg 08 | - | FC St. Pauli II | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 20.08.2017 | FC St. Pauli II | - | VfV Hildesheim | 5:0 | ||||
| 5. Spieltag | 26.08.2017 | SSV Jeddeloh II | - | FC St. Pauli II | 1:6 | ||||
| 7. Spieltag | 09.09.2017 | VfL Wolfsburg II | - | FC St. Pauli II | 1:0 | ||||
| 11. Spieltag | 20.09.2017 | FC St. Pauli II | - | Hannover 96 II | 0:4 | ||||
| 9. Spieltag | 23.09.2017 | Hamburger SV II | - | FC St. Pauli II | 3:1 | ||||
| 13. Spieltag | 22.10.2017 | FC St. Pauli II | - | Lüneburger SK Hansa | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 07.03.2018 | Eintracht Braunschweig II | - | FC St. Pauli II | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 07.04.2018 | Hannover 96 II | - | FC St. Pauli II | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 15.04.2018 | FC St. Pauli II | - | TSV Havelse | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 18.04.2018 | VfB Oldenburg | - | FC St. Pauli II | 2:0 |  |
|||
| 31. Spieltag | 21.04.2018 | Lüneburger SK Hansa | - | FC St. Pauli II | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 26.04.2018 | VfB Lübeck | - | FC St. Pauli II | 4:2 | ||||
| 20. Spieltag | 09.05.2018 | VfV Hildesheim | - | FC St. Pauli II | 0:3 | ||||
| 34. Spieltag | 12.05.2018 | FC St. Pauli II | - | Altona 93 | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 16.05.2018 | FC St. Pauli II | - | SSV Jeddeloh II | 3:2 | |
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