| 32. Spieltag | 10.02.2007 | Peterborough United | - | Wrexham FC | 3:0 | ||||
| 33. Spieltag | 17.02.2007 | Macclesfield Town | - | Peterborough United | 2:1 | ||||
| 34. Spieltag | 20.02.2007 | Peterborough United | - | Boston United | 1:1 | ||||
| 35. Spieltag | 24.02.2007 | Bury FC | - | Peterborough United | 0:3 |  |
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| 36. Spieltag | 03.03.2007 | Peterborough United | - | Notts County | 2:0 | ||||
| 37. Spieltag | 10.03.2007 | Peterborough United | - | Milton Keynes Dons | 4:0 | |
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| 38. Spieltag | 16.03.2007 | Shrewsbury Town | - | Peterborough United | 2:1 | ||||
| 39. Spieltag | 24.03.2007 | Grimsby Town | - | Peterborough United | 0:2 | ||||
| 40. Spieltag | 31.03.2007 | Peterborough United | - | Wycombe Wanderers | 3:3 | |
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| 41. Spieltag | 07.04.2007 | Accrington Stanley | - | Peterborough United | 3:2 | |
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| 42. Spieltag | 09.04.2007 | Peterborough United | - | Mansfield Town | 2:0 | |
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| 43. Spieltag | 14.04.2007 | Torquay United | - | Peterborough United | 1:1 | |
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| 44. Spieltag | 21.04.2007 | Peterborough United | - | Hereford United | 3:0 | |
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| 45. Spieltag | 28.04.2007 | Chester City | - | Peterborough United | 1:1 | |
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| 46. Spieltag | 05.05.2007 | Peterborough United | - | Rochdale AFC | 3:3 |
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