| 7. Spieltag | 18.09.2012 | Gillingham FC | - | Southend United | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 22.09.2012 | Southend United | - | Exeter City | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 29.09.2012 | Plymouth Argyle | - | Southend United | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 02.10.2012 | Southend United | - | Burton Albion | 0:1 | ||||
| 39. Spieltag | 16.03.2013 | Southend United | - | Torquay United | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 19.03.2013 | Southend United | - | Plymouth Argyle | 0:2 | ||||
| 44. Spieltag | 13.04.2013 | Southend United | - | Bristol Rovers | 0:0 | ||||
| 43. Spieltag | 16.04.2013 | Aldershot Town | - | Southend United | 0:2 | ||||
| 45. Spieltag | 20.04.2013 | York City | - | Southend United | 2:1 |
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