| 23. Spieltag | 21.12.2012 | Swindon Town | - | Tranmere Rovers | 5:0 | ||||
| 24. Spieltag | 26.12.2012 | Tranmere Rovers | - | Crewe Alexandra | 2:1 | ||||
| 25. Spieltag | 29.12.2012 | Tranmere Rovers | - | Scunthorpe United | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 01.01.2013 | Bury FC | - | Tranmere Rovers | 0:1 |  |
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| 28. Spieltag | 12.01.2013 | Tranmere Rovers | - | Crawley Town | 2:0 | |
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| 27. Spieltag | 16.01.2013 | Coventry City | - | Tranmere Rovers | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 19.01.2013 | Brentford FC | - | Tranmere Rovers | 1:2 | ||||
| 31. Spieltag | 02.02.2013 | Tranmere Rovers | - | Carlisle United | 0:1 | ||||
| 32. Spieltag | 09.02.2013 | Leyton Orient | - | Tranmere Rovers | 2:1 | ||||
| 33. Spieltag | 15.02.2013 | Tranmere Rovers | - | Shrewsbury Town | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 19.02.2013 | Tranmere Rovers | - | Swindon Town | 1:3 |  |
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| 35. Spieltag | 26.02.2013 | Tranmere Rovers | - | Notts County | 1:1 | ||||
| 38. Spieltag | 12.03.2013 | Walsall FC | - | Tranmere Rovers | 2:0 |
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