| 1. Spieltag | 04.08.2012 | SV Bergisch Gladbach 09 | - | MSV Duisburg II | 2:0 | ||||
| 7. Spieltag | 14.09.2012 | Viktoria Köln | - | MSV Duisburg II | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 21.09.2012 | MSV Duisburg II | - | Rot-Weiß Oberhausen | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 26.09.2012 | MSV Duisburg II | - | Bor. Mönchengladbach II | 0:0 | ||||
| 11. Spieltag | 06.10.2012 | MSV Duisburg II | - | Wuppertaler SV | 3:3 |  |
|||
| 13. Spieltag | 27.10.2012 | MSV Duisburg II | - | Sportfreunde Siegen | 0:3 | ||||
| 21. Spieltag | 30.01.2013 | VfB Hüls | - | MSV Duisburg II | 2:1 | ||||
| 22. Spieltag | 02.02.2013 | MSV Duisburg II | - | Bayer Leverkusen II | 0:2 | ||||
| 27. Spieltag | 10.03.2013 | Rot-Weiß Oberhausen | - | MSV Duisburg II | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 30.03.2013 | MSV Duisburg II | - | VfL Bochum II | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 02.04.2013 | Bor. Mönchengladbach II | - | MSV Duisburg II | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 07.04.2013 | Wuppertaler SV | - | MSV Duisburg II | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 13.04.2013 | MSV Duisburg II | - | Sportfreunde Lotte | 0:2 |  |
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