| 2. Spieltag | 06.08.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Wuppertaler SV | 2:2 | ||||
| 3. Spieltag | 09.08.2016 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiss Essen | 0:0 | ||||
| 6. Spieltag | 27.08.2016 | SC Verl | - | Wuppertaler SV | 2:2 | ||||
| 7. Spieltag | 05.09.2016 | Wuppertaler SV | - | Alemannia Aachen | 2:2 | ||||
| 8. Spieltag | 10.09.2016 | Borussia Dortmund II | - | Wuppertaler SV | 0:0 | ||||
| 10. Spieltag | 24.09.2016 | 1. FC Köln II | - | Wuppertaler SV | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 01.10.2016 | Wuppertaler SV | - | Sportfreunde Siegen | 4:1 | ||||
| 12. Spieltag | 08.10.2016 | SG Wattenscheid 09 | - | Wuppertaler SV | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 15.10.2016 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Oberhausen | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 22.10.2016 | TSG Sprockhövel | - | Wuppertaler SV | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 29.10.2016 | Wuppertaler SV | - | SC Wiedenbrück | 1:1 | ||||
| 16. Spieltag | 05.11.2016 | Bonner SC | - | Wuppertaler SV | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 25.03.2017 | FC Schalke 04 II | - | Wuppertaler SV | 4:2 |  |
|||
| 30. Spieltag | 23.04.2017 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Wuppertaler SV | 2:0 |
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