| 1. Runde | 20.08.2005 | FC St. Pauli | - | Wacker Burghausen | 3:2 n.V. |  |
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| 2. Runde | 25.10.2005 | FC St. Pauli | - | VfL Bochum | 4:0 | |
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| Achtelfinale | 21.12.2005 | FC St. Pauli | - | Hertha BSC | 4:3 n.V. | |
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| Viertelfinale | 25.01.2006 | FC St. Pauli | - | Werder Bremen | 3:1 | ||||
| Halbfinale | 12.04.2006 | FC St. Pauli | - | Bayern München | 0:3 |
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