| 5. Spieltag | 11.08.2012 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | SV Babelsberg 03 | 2:1 | ||||
| 12. Spieltag | 29.09.2012 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | Hallescher FC | 3:1 | ||||
| 13. Spieltag | 06.10.2012 | VfB Stuttgart II | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:2 |  |
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| 14. Spieltag | 20.10.2012 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | VfL Osnabrück | 1:3 | ||||
| 15. Spieltag | 27.10.2012 | Arminia Bielefeld | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 02.11.2012 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | Alemannia Aachen | 1:1 | |
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| 17. Spieltag | 10.11.2012 | Borussia Dortmund II | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 2:1 |
Deutschland