| 7. Spieltag | 03.09.2005 | Bristol City | - | Colchester United | 0:0 |  |
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| 8. Spieltag | 10.09.2005 | Colchester United | - | Doncaster Rovers | 3:2 | ||||
| 9. Spieltag | 17.09.2005 | Port Vale FC | - | Colchester United | 0:1 | ||||
| 10. Spieltag | 24.09.2005 | Colchester United | - | Huddersfield Town | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 27.09.2005 | Bradford City | - | Colchester United | 1:1 | |
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| 12. Spieltag | 01.10.2005 | Colchester United | - | Chesterfield FC | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 09.10.2005 | Blackpool FC | - | Colchester United | 1:2 | ||||
| 28. Spieltag | 14.01.2006 | Walsall FC | - | Colchester United | 0:2 | ||||
| 31. Spieltag | 04.02.2006 | Colchester United | - | Bradford City | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 07.02.2006 | Colchester United | - | Scunthorpe United | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 11.02.2006 | Huddersfield Town | - | Colchester United | 2:0 |  |
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| 39. Spieltag | 25.03.2006 | Scunthorpe United | - | Colchester United | 0:0 | ||||
| 40. Spieltag | 01.04.2006 | Colchester United | - | Brentford FC | 1:1 | ||||
| 41. Spieltag | 08.04.2006 | Nottingham Forest | - | Colchester United | 1:0 | ||||
| 34. Spieltag | 11.04.2006 | Colchester United | - | Hartlepool United | 2:0 |
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