| 20. Spieltag | 28.02.2009 | SC Freiburg II | - | Waldhof Mannheim | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 14.03.2009 | Waldhof Mannheim | - | Viktoria Aschaffenburg | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 22.03.2009 | Eintracht Frankfurt II | - | Waldhof Mannheim | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 13.05.2009 | Waldhof Mannheim | - | Karlsruher SC II | 3:0 |  |
|||
| 31. Spieltag | 17.05.2009 | 1. FC Nürnberg II | - | Waldhof Mannheim | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 30.05.2009 | SSV Ulm 1846 | - | Waldhof Mannheim | 0:1 |
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