| 1. Spieltag | 29.07.2017 | Weiche Flensburg 08 | - | FC St. Pauli II | 1:1 |  |
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| 2. Spieltag | 06.08.2017 | FC St. Pauli II | - | Eintracht Norderstedt | 1:1 |  |
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| 4. Spieltag | 20.08.2017 | FC St. Pauli II | - | VfV Hildesheim | 5:0 | |
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| 5. Spieltag | 26.08.2017 | SSV Jeddeloh II | - | FC St. Pauli II | 1:6 | |
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| 6. Spieltag | 03.09.2017 | FC St. Pauli II | - | SV Drochtersen/Assel | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 01.10.2017 | FC St. Pauli II | - | VfB Lübeck | 2:1 | |
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| 12. Spieltag | 15.10.2017 | TSV Havelse | - | FC St. Pauli II | 0:4 | |
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| 17. Spieltag | 17.11.2017 | FC St. Pauli II | - | Eintracht Braunschweig II | 2:3 | |
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| 29. Spieltag | 07.04.2018 | Hannover 96 II | - | FC St. Pauli II | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 09.05.2018 | VfV Hildesheim | - | FC St. Pauli II | 0:3 |
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