| 6. Spieltag | 01.09.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | FC 08 Homburg | 1:3 | ||||
| 8. Spieltag | 11.09.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | FSV Frankfurt II | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 15.09.2012 | Wormatia Worms | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:4 | ||||
| 10. Spieltag | 23.09.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC 07 Idar-Oberstein | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 30.09.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Waldhof Mannheim | 0:1 | ||||
| 13. Spieltag | 14.10.2012 | TuS Koblenz | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:0 |  |
|||
| 14. Spieltag | 20.10.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Hessen Kassel | 4:4 | ||||
| 15. Spieltag | 27.10.2012 | SV 07 Elversberg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 2:5 | ||||
| 19. Spieltag | 24.11.2012 | SSV Ulm 1846 | - | 1. FSV Mainz 05 II | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 05.03.2013 | 1899 Hoffenheim II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 09.03.2013 | FC 08 Homburg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 27.03.2013 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Wormatia Worms | 3:3 | ||||
| 31. Spieltag | 13.04.2013 | Waldhof Mannheim | - | 1. FSV Mainz 05 II | 2:2 | ||||
| 37. Spieltag | 18.05.2013 | SG Sonnenhof Großaspach | - | 1. FSV Mainz 05 II | 3:1 |
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