| 21. Spieltag | 09.02.2024 | FC Schaffhausen | - | FC Thun Berner Oberland | 1:1 |  |
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| 22. Spieltag | 17.02.2024 | FC Baden | - | FC Schaffhausen | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 03.03.2024 | FC Vaduz | - | FC Schaffhausen | 3:2 | ||||
| 25. Spieltag | 08.03.2024 | FC Schaffhausen | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 15.03.2024 | FC Schaffhausen | - | AC Bellinzona | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 29.03.2024 | Neuchâtel Xamax FCS | - | FC Schaffhausen | 2:1 | ||||
| 28. Spieltag | 06.04.2024 | FC Aarau | - | FC Schaffhausen | 1:2 | |
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| 30. Spieltag | 19.04.2024 | FC Schaffhausen | - | Neuchâtel Xamax FCS | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 23.04.2024 | AC Bellinzona | - | FC Schaffhausen | 1:1 | ||||
| 32. Spieltag | 27.04.2024 | FC Wil 1900 | - | FC Schaffhausen | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 17.05.2024 | FC Schaffhausen | - | FC Baden | 2:2 | ||||
| 36. Spieltag | 20.05.2024 | FC Sion | - | FC Schaffhausen | 3:0 |
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