| 1. Spieltag | 20.09.2020 | 1. FC Magdeburg | - | Hallescher FC | 0:2 | ||||
| 2. Spieltag | 26.09.2020 | TSV 1860 München | - | 1. FC Magdeburg | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 03.10.2020 | 1. FC Magdeburg | - | Viktoria Köln | 0:2 | ||||
| 4. Spieltag | 10.10.2020 | Dynamo Dresden | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 | ||||
| 5. Spieltag | 16.10.2020 | 1. FC Magdeburg | - | Türkgücü München | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 22.11.2020 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 |  |
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| 13. Spieltag | 28.11.2020 | FSV Zwickau | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 04.12.2020 | 1. FC Magdeburg | - | SV Meppen | 0:0 | ||||
| 24. Spieltag | 15.02.2021 | Türkgücü München | - | 1. FC Magdeburg | 2:1 |  |
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| 25. Spieltag | 21.02.2021 | 1. FC Magdeburg | - | SC Verl | 0:4 | ||||
| 26. Spieltag | 27.02.2021 | SV Wehen Wiesbaden | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 02.03.2021 | Viktoria Köln | - | 1. FC Magdeburg | 2:4 | |
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| 27. Spieltag | 06.03.2021 | 1. FC Magdeburg | - | Waldhof Mannheim | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 13.03.2021 | Bayern München II | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | |
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