| 2. Spieltag | 03.08.2024 | 1. FC Köln II | - | SC Paderborn 07 II | 5:0 | ||||
| 3. Spieltag | 09.08.2024 | Bor. Mönchengladbach II | - | SC Paderborn 07 II | 2:1 | ||||
| 4. Spieltag | 18.08.2024 | Wuppertaler SV | - | SC Paderborn 07 II | 1:4 |  |
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| 5. Spieltag | 23.08.2024 | SC Paderborn 07 II | - | MSV Duisburg | 2:1 | ||||
| 6. Spieltag | 01.09.2024 | Sportfreunde Lotte | - | SC Paderborn 07 II | 3:2 | |
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| 7. Spieltag | 13.09.2024 | SC Paderborn 07 II | - | FC Gütersloh | 1:2 |  |
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| 8. Spieltag | 20.09.2024 | Türkspor Dortmund | - | SC Paderborn 07 II | annull. | |
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| 9. Spieltag | 28.09.2024 | SC Paderborn 07 II | - | Rot-Weiß Oberhausen | 3:1 | |
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| 10. Spieltag | 05.10.2024 | Eintracht Hohkeppel | - | SC Paderborn 07 II | 1:1 |
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