| 5. Spieltag | 13.09.2015 | SuS Stadtlohn | - | SC Paderborn 07 II | 3:3 | ||||
| 6. Spieltag | 20.09.2015 | SC Paderborn 07 II | - | SpVgg Erkenschwick | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 25.09.2015 | Westfalia Rhynern | - | SC Paderborn 07 II | 4:0 | ||||
| 8. Spieltag | 04.10.2015 | SC Paderborn 07 II | - | SuS Neuenkirchen | 3:1 |  |
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| 10. Spieltag | 17.10.2015 | SC Paderborn 07 II | - | Arminia Bielefeld II | 3:2 | |
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| 11. Spieltag | 25.10.2015 | FC Gütersloh 2000 | - | SC Paderborn 07 II | 0:2 | |
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| 12. Spieltag | 08.11.2015 | SC Paderborn 07 II | - | Sportfreunde Siegen | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 05.12.2015 | Hammer SpVg | - | SC Paderborn 07 II | 2:2 | |
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| 16. Spieltag | 13.12.2015 | SC Paderborn 07 II | - | FCE Rheine | 2:2 | |
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| 23. Spieltag | 20.03.2016 | SpVgg Erkenschwick | - | SC Paderborn 07 II | 2:1 | ||||
| 28. Spieltag | 17.04.2016 | SC Paderborn 07 II | - | FC Gütersloh 2000 | 2:1 | |
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| 29. Spieltag | 23.04.2016 | Sportfreunde Siegen | - | SC Paderborn 07 II | 4:1 |  |
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| 30. Spieltag | 30.04.2016 | SC Paderborn 07 II | - | TSV Marl-Hüls | 2:3 | |
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