| 7. Spieltag | 15.09.2012 | FC Kray | - | Wuppertaler SV | 0:1 | ||||
| 9. Spieltag | 25.09.2012 | SC Wiedenbrück | - | Wuppertaler SV | 4:0 | ||||
| 10. Spieltag | 28.09.2012 | Wuppertaler SV | - | Viktoria Köln | 2:2 | ||||
| 11. Spieltag | 06.10.2012 | MSV Duisburg II | - | Wuppertaler SV | 3:3 | ||||
| 12. Spieltag | 20.10.2012 | Wuppertaler SV | - | Bor. Mönchengladbach II | 0:2 | ||||
| 13. Spieltag | 27.10.2012 | VfL Bochum II | - | Wuppertaler SV | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 03.11.2012 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Oberhausen | 3:1 | ||||
| 15. Spieltag | 09.11.2012 | Wuppertaler SV | - | Sportfreunde Lotte | 0:1 | ||||
| 16. Spieltag | 18.11.2012 | Sportfreunde Siegen | - | Wuppertaler SV | 0:0 | ||||
| 17. Spieltag | 24.11.2012 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiss Essen | 2:2 |  |
|||
| 19. Spieltag | 01.12.2012 | Wuppertaler SV | - | SC Verl | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 14.12.2012 | Fortuna Köln | - | Wuppertaler SV | 1:1 | |
|||
| 32. Spieltag | 20.04.2013 | Wuppertaler SV | - | VfL Bochum II | 0:2 | ||||
| 35. Spieltag | 07.05.2013 | Wuppertaler SV | - | Sportfreunde Siegen | 2:2 | ||||
| 36. Spieltag | 10.05.2013 | Rot-Weiss Essen | - | Wuppertaler SV | 1:2 | |
|||
| 37. Spieltag | 19.05.2013 | Wuppertaler SV | - | SSVg Velbert | 2:3 | |
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