| 13. Spieltag | 14.11.2008 | Preußen Münster | - | Bayer Leverkusen II | 5:1 | ||||
| 14. Spieltag | 21.11.2008 | SV 07 Elversberg | - | Preußen Münster | 1:0 | ||||
| 15. Spieltag | 28.11.2008 | Preußen Münster | - | FSV Oggersheim | 1:1 | ||||
| 16. Spieltag | 06.12.2008 | Borussia Dortmund II | - | Preußen Münster | 3:1 | ||||
| 17. Spieltag | 12.12.2008 | Preußen Münster | - | Sportfreunde Lotte | 0:1 | ||||
| 18. Spieltag | 19.12.2008 | Preußen Münster | - | FC Schalke 04 II | 3:0 | ||||
| 19. Spieltag | 21.02.2009 | 1. FC Kaiserslautern II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 28.02.2009 | Preußen Münster | - | VfL Bochum II | 1:2 | ||||
| 24. Spieltag | 28.03.2009 | Preußen Münster | - | Wormatia Worms | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 13.04.2009 | SC Verl | - | Preußen Münster | 0:1 |  |
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| 26. Spieltag | 19.04.2009 | Rot-Weiss Essen | - | Preußen Münster | 0:4 |  |
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| 27. Spieltag | 25.04.2009 | Preußen Münster | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:4 |
Deutschland