| 18. Spieltag | 05.02.2000 | BFC Dynamo | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 |  |
|||
| 19. Spieltag | 12.02.2000 | FSV Zwickau | - | BFC Dynamo | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 19.02.2000 | BFC Dynamo | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:2 | ||||
| 21. Spieltag | 27.02.2000 | Hertha BSC II | - | BFC Dynamo | 3:1 | ||||
| 22. Spieltag | 04.03.2000 | BFC Dynamo | - | VfL Halle 96 | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 26.03.2000 | VFC Plauen | - | BFC Dynamo | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 11.04.2000 | Erzgebirge Aue | - | BFC Dynamo | 1:0 |
Tschechien