| 22. Spieltag | 16.02.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Hamburger SV II | 2:0 |  |
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| 23. Spieltag | 23.02.2008 | Dynamo Dresden | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 |  |
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| 24. Spieltag | 02.03.2008 | 1. FC Magdeburg | - | SC Verl | 2:0 | |
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| 26. Spieltag | 15.03.2008 | VfB Lübeck | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | |
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| 27. Spieltag | 22.03.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 | |
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| 28. Spieltag | 29.03.2008 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 | |
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| 29. Spieltag | 05.04.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Rot Weiss Ahlen | 2:2 | |
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| 30. Spieltag | 13.04.2008 | Borussia Dortmund II | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 31. Spieltag | 18.04.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Kickers Emden | 1:3 | ||||
| 32. Spieltag | 27.04.2008 | VfL Wolfsburg II | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 33. Spieltag | 03.05.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 | |
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| 35. Spieltag | 10.05.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:3 | |
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| 36. Spieltag | 17.05.2008 | 1. FC Union Berlin | - | 1. FC Magdeburg | 1:2 | ||||
| 37. Spieltag | 24.05.2008 | 1. FC Magdeburg | - | Rot-Weiss Essen | 0:1 | |
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| 38. Spieltag | 31.05.2008 | Wuppertaler SV | - | 1. FC Magdeburg | 1:2 | |
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