| 26. Spieltag | 07.01.2017 | Scunthorpe United | - | Bury FC | 3:2 | ||||
| 27. Spieltag | 14.01.2017 | Bury FC | - | Peterborough United | 5:1 | ||||
| 28. Spieltag | 20.01.2017 | Port Vale FC | - | Bury FC | 2:2 | ||||
| 29. Spieltag | 28.01.2017 | Bury FC | - | Walsall FC | 3:3 |  |
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| 30. Spieltag | 04.02.2017 | Shrewsbury Town | - | Bury FC | 2:1 | ||||
| 31. Spieltag | 11.02.2017 | Bury FC | - | Swindon Town | 1:0 | |
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| 43. Spieltag | 13.04.2017 | Bury FC | - | Rochdale AFC | 0:1 |
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