| 5. Spieltag | 25.03.2006 | RB Omiya Ardija | - | Shimizu S-Pulse | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 01.04.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Gamba Osaka | 2:3 | ||||
| 7. Spieltag | 09.04.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Oita Trinita | 4:1 | ||||
| 8. Spieltag | 15.04.2006 | Kashima Antlers | - | Shimizu S-Pulse | 3:1 | ||||
| 18. Spieltag | 19.08.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Ventforet Kofu | 4:0 | ||||
| 25. Spieltag | 01.10.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Avispa Fukuoka | 4:0 |  |
|||
| 26. Spieltag | 07.10.2006 | Cerezo Osaka | - | Shimizu S-Pulse | 1:1 | |
|||
| 28. Spieltag | 21.10.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Albirex Niigata | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 18.11.2006 | Yokohama F. Marinos | - | Shimizu S-Pulse | 2:3 | ||||
| 32. Spieltag | 23.11.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Kawasaki Frontale | 4:3 |
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