| 2. Spieltag | 05.08.2016 | FC Schalke 04 II | - | 1. FC Köln II | 0:1 | ||||
| 3. Spieltag | 09.08.2016 | Sportfreunde Siegen | - | FC Schalke 04 II | 1:2 | ||||
| 5. Spieltag | 20.08.2016 | Rot-Weiß Oberhausen | - | FC Schalke 04 II | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 27.08.2016 | FC Schalke 04 II | - | TSG Sprockhövel | 2:0 | ||||
| 1. Spieltag | 30.08.2016 | Bor. Mönchengladbach II | - | FC Schalke 04 II | 3:0 | ||||
| 7. Spieltag | 03.09.2016 | SC Wiedenbrück | - | FC Schalke 04 II | 1:2 | ||||
| 9. Spieltag | 17.09.2016 | Wuppertaler SV | - | FC Schalke 04 II | 0:2 | ||||
| 13. Spieltag | 15.10.2016 | SV Rödinghausen | - | FC Schalke 04 II | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 19.02.2017 | SG Wattenscheid 09 | - | FC Schalke 04 II | 2:1 | ||||
| 25. Spieltag | 19.03.2017 | Bonner SC | - | FC Schalke 04 II | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 01.04.2017 | Viktoria Köln | - | FC Schalke 04 II | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 09.04.2017 | FC Schalke 04 II | - | Fortuna Düsseldorf II | 4:0 | ||||
| 29. Spieltag | 13.04.2017 | Rot-Weiss Essen | - | FC Schalke 04 II | 1:0 |  |
|||
| 33. Spieltag | 13.05.2017 | Alemannia Aachen | - | FC Schalke 04 II | 3:2 | ||||
| 34. Spieltag | 20.05.2017 | FC Schalke 04 II | - | Borussia Dortmund II | 0:1 |
Deutschland