| 22. Spieltag | 26.12.2008 | Peterborough United | - | Millwall FC | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 28.12.2008 | Millwall FC | - | Yeovil Town | 1:1 |  |
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| 32. Spieltag | 14.02.2009 | Stockport County | - | Millwall FC | 2:2 | ||||
| 33. Spieltag | 21.02.2009 | Millwall FC | - | Brighton & Hove Albion | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 28.02.2009 | Millwall FC | - | Oldham Athletic | 2:3 | ||||
| 35. Spieltag | 03.03.2009 | Southend United | - | Millwall FC | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 07.03.2009 | Huddersfield Town | - | Millwall FC | 1:2 | ||||
| 37. Spieltag | 10.03.2009 | Millwall FC | - | Northampton Town | 1:0 | ||||
| 27. Spieltag | 17.03.2009 | Milton Keynes Dons | - | Millwall FC | 0:1 | ||||
| 39. Spieltag | 21.03.2009 | Hartlepool United | - | Millwall FC | 2:3 | ||||
| 42. Spieltag | 10.04.2009 | Yeovil Town | - | Millwall FC | 2:0 | ||||
| 43. Spieltag | 13.04.2009 | Millwall FC | - | Peterborough United | 2:0 | ||||
| 44. Spieltag | 18.04.2009 | Bristol Rovers | - | Millwall FC | 4:2 | |
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| 46. Spieltag | 02.05.2009 | Carlisle United | - | Millwall FC | 2:0 |
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